L'œsophagite infectieuse se développe lorsque des virus (par exemple l'herpès ou le CMV), des champignons (Candida) ou des bactéries infectent l'œsophage, le plus souvent sur un terrain d'immunodépression. Les symptômes incluent une douleur à la déglutition, de la fièvre, une difficulté à avaler les solides et les liquides, et parfois des brûlures d'estomac. Le diagnostic repose sur une endoscopie avec prélèvements de cultures, et le traitement est adapté à l'agent causala0: médicaments antiviraux, antifongiques ou antibiotiques.
Il s'agit d'une inflammation relativement rare qui touche principalement des personnes dont le système immunitaire est affaibli, comme celles atteintes du SIDA ou d'un cancer.